对中国要求日方道歉和赔偿，日本首相菅直人再次以强硬态度表示拒绝。此情势下，日本非法扣押中国船长所引发的钓岛外交战，仍无降温迹象，经贸交往等方面的对峙还在持续胶着。据台媒报道，中国部分海关开始泡沫发生器对进出口日本的商品大幅加强检查力度，从而引发因手续趋严而耽搁通关的事件频传，令日本政府急于确认并掌握实际情况。在东京举行的世界旅行博览会，中国旅游局取消参展，使展会出现一个尴尬的“窿”。与此同时，大陆民间拒买日货声浪高涨。
据中央社援引“读卖新闻”报道，上海海关日前通知日本主要的运输业者，通常只有3成的抽样检查将提高至100%，由于全部产品检查费时，预定出口至日本的电子零组件已出现无法即时运上飞机的问题。此外，福建螺带式混合机省、广东省和辽宁省的海关也提高抽样检查的比例或进行全部检查，并要求通关资料除英文之外也要追加中文资料。
广东省海关总署一位杨姓工作人员称，不了解这一情况，目前也并未收到海关总署下达的相关文件，他表示，地方上虽然对进出口抽样检查有一定自主权，但空间不大。中国通关趋严可能是中国针对渔船事件而采乳化机取的措施，其对日本企业的影响不可忽视。
中国人民大学国际关系学院副院长金灿荣表示，从目前来看，若只是几个省份出现对日通关趋严的行为，应该是渔船事件的后遗症，是民间表达气愤的一个反应。从近期中日双方领导人的发言分析，双方对未来中日关系仍在使用战略互惠关系言论，因此互惠框架仍没有改变，长期的中日经贸等政策不螺带式混合机会改变。
另据报道，在东京台场举行的世界旅行博览会上，全球139个国家及地区的旅游部门及机构参展，是亚洲最大型旅游业活乳化机动，但混合器原本是中国旅游局摊位的地方却空空如也，只是挂上告示，表示旅游局因特殊原因停止参展。主办单位表示，中方在上星期四傍晚突然通知，因为撞船事件没有解决，决定取消参展，会场内有一大片地方空空荡荡。虽然日方周五已经放人，但仍然拒绝道歉，因此中方仍然持续施压，中断所有交流活动。
另一篇报道称，在这场近年最激烈的中日外交冲突中，美国的角色不言而喻，因此情况更加错综复杂。《华盛顿邮报》26日发表混合机大篇幅报道，将中日钓鱼岛撞船事件和2001年的中美南海撞机事件相提并论。另有华文媒体的评论指出，中国受美国步步进逼，然而由日方挑起的这场外交战却成为中国一个显身手的机会。事实上，中方的强硬不仅止于政府，民间拒买日货的声浪由大陆传到海外。
27日出版的《人民日报》发表题为《应该汲取的教训》的评论文章说，日本方面在钓鱼岛海域非法抓扣中国渔民和渔船，使中日关系呼吸阀良好发展势头遭受严重破坏。事件发生以来，日本方面的一些言论、行动，反映出日方国内的确有一些政治势力试图“借事发力”，大做“文章”。这篇“文章”有两个“小算盘”：一是采取主观唯心的“鸵鸟政策”，试图用日本国内法来处理此事，形成所谓的“裁判案例”，迫使中国接受“既成事实”；二是利用中日双方矛盾激化来渲染所谓“中国威胁论”，进而顺势以“美军威慑论”来推动普天间机场问题的解决和日美同盟的深化，调整防卫战略和军事部署，尤其是强化针对中国的西南诸岛防卫。
文章说，历史上，日本利用“对外事件”做文章的先例并不鲜见，其目的无非有二——“以外补内”和“以外补外”。“以外补内”方面的例子是，菅直人和小泽一郎在选举辩论中都以钓鱼岛为题，发表挑衅中国的言论，煽动和拉拢国内民意，这是所谓的“选举政治”。至于“以外补外”方面的典型案例，当属日方一些势力，主要是右翼保守派和少壮战略派在此次事件上的所作所为。它们的意图就在借机争取外交安全政策的调整和突破。